Во второй части протокола прорабатываются следующие психологические предпосылки: геморрой, герпес, гипертериоз (гиперфункция щитовидной железы), гипертония, или эссенциальная гипертензия (повышенное давление), гипотония или гипотензия (пониженное давление), гипогликемия (понижение содержания глюкозы в крови), головные боли, горло (болезни горла), бронхит, грипп и простудные заболевания, груди (заболевания), депрессия, диабет, диарея, дискинезия желчевыводящих путей.